Elle définit un règlement fixant les obligations de la Fédération à l'égard de ses licenciés en matière médicale.

Elle est composée :

- du médecin fédéral réprésentant le Président Fédéral
- d'un membre du Comité Directeur
- d'un médecin
- d'un masseur kinésithérapeute fédéral
- d'un délégué de chaque spécialité

Ses missions :

- élaborer le règlement médical de la Fédération
- organiser la prévention
- organiser la surveillance médicale des licenciés compétiteurs de haut niveau
- organiser la lutte antidopage
- établir annuellement le bilan des actions réalisées.

Elle est présente dans les grandes manifestations fédérales et joue un rôle de conseil et d'information auprès des comités régionaux et départementaux.